MassARRAY® System ผลิตภัณฑ์ของบริษัท Agena Bioscience ประเทศสหรัฐอเมริกา เป็นชุดเครื่องมือตรวจวิเคราะห์ DNA และ RNA ที่สามารถตรวจวิเคราะห์ได้ทั้งในเชิงปริมาณ และเชิงคุณภาพ โดยไม่ได้อาศัยหลักการติดฉลากสารเรืองแสง (non-fluorescent detection) เหมือนเทคนิคอื่นๆ ทั่วไป โดย MassARRAY® System นั้นจะมีจุดเด่นที่เป็นเอกลักษณ์เฉพาะ (unique technique) ในการตรวจวิเคราะห์ซึ่งอาศัยหลักการ primer extension ร่วมกับการใช้เครื่อง MassARRAY ซึ่งเป็นเครื่องมือวิเคราะห์น้ำหนักโมเลกุลของ DNA ที่มีความละเอียดสูงชนิด MALDI-TOF MS เพื่อวิเคราะห์ความแตกต่างและความจำเพาะของน้ำหนักโมเลกุล (mass) ของเบสบนสายนิวคลีโอไทด์ (nucleotide) ร่วมกับการประมวลผลโดยอาศัยโปรแกรม ที่ออกแบบมาเฉพาะกับงานด้านจีโนมิกส์ สามารถประมวลผลให้ข้อมูลที่เข้าใจง่าย สะดวกต่อการใช้งาน มีความแม่นยำสูงถึง 99.7% ในขณะที่มี อัตราความต่ำเพียง 2% สามารถตรวจวิเคราะห์สารพันธุกรรมได้คราวละหลายตำแหน่งเป็น multiplexed assays โดยใช้ระยะเวลาในการตรวจวิเคราะห์อย่างรวดเร็ว และสามารถรายงานผลได้ภายใน 8 ชั่วโมง มีราคาประหยัดเมื่อเทียบกับเทคนิคอื่น ปัจจุบันเทคนิค MassARRAY เป็นที่ยอมรับ และมีการตีพิมพ์ในวารสารงานวิจัยมากกว่า 3,000 ฉบับ สามารถนำไปใช้ในงานหลากหลาย Application ได้แก่ การตรวจวิเคราะห์ genotyping (ทั้งชนิด SNPs และ INDEL), Somatic Mutation, Ultrasensitive Analysis, Quantitative Gene Expression และ Methylation Analysis
ชุด MassARRAY® System ร่วมกับชุดน้ำยา iPLEX® chemistry สามารถใช้ศึกษาในงานทางด้าน genotyping อันได้แก่ single nucleotide variations/polymorphisms (SNPs), insertions and deletions (indels) และ copy number variation (CNV) ซึ่งในปัจจุบันมีชุดตรวจวิเคราะห์สำเร็จรูปที่ถูกพัฒนาและสามารถใช้ได้ในกลุ่มงานทางด้านต่างๆ ดังนี้
Cancer Panelsปัจจุบันทาง Agena Bioscience ได้พัฒนาชุดน้ำยา UltraSEEK™ ขึ้น เพื่อตอบสนองในกลุ่มงานวิจัยที่มี low abundance somatic mutations สามารถตรวจวัดโดยให้ sensitivity ต่ำสุดที่ 0.1% ด้วยชุดน้ำยานี้สามารถใช้วิเคราะห์กับตัวอย่างในกลุ่ม degraded sample ได้ เช่น liquid biopsy, needle aspirates และ formalin-fixed paraffin-embedded tissue (FFPF) เป็นต้น
การศึกษา epigenetics ที่ปัจจุบันมีการศึกษากันอย่างกว้างขวางคือ DNA methylation ทางบริษัท Agena Bioscience ได้จัดทำ application รองรับงานทางด้าน DNA methylation โดยมีการออกแบบชุดซอฟต์แวร์ EpiTYPER สามารถดูตำแหน่ง methylation ได้หลายตำแหน่งพร้อมๆ กัน และสามารถตรวจเปอร์เซ็นต์ methylation ต่ำสุดได้ถึง 5% โดยชุดน้ำยาถูกออกแบบให้สามารถทำการตรวจได้อย่างรวดเร็ว ตั้งแต่ได้ตัวอย่าง bisulfite-treated DNA จนรายงานผลใช้เวลาไม่เกิน 8 ชั่วโมง
ปัจจุบันความรู้ในระดับโมเลกุลทั้งในพืช และสัตว์ มีความก้าวหน้าและเป็นที่รู้จักกันอย่างแพร่หลาย การพัฒนาองค์ความรู้เหล่านั้นเพื่อให้เกิดประโยชน์สูงสุดเป็นสิ่งสำคัญ อาทิเช่น การเพิ่มผลผลิต และการพัฒนาสายพันธุ์ เป็นต้น
เครื่อง MassARRAY® นับเป็นเทคโนโลยีหนึ่งที่สามารถเข้ามามีบทบาทในงานทางด้าน Agricultural Genomics เนื่องจากสามารถศึกษา SNP หลายๆ ตำแหน่งพร้อมกัน (60 SNPs in a single multiplex assay) รองรับตัวอย่างได้เป็นจำนวนมาก (hundreds to thousands of specimens per day) มีเปอร์เซ็นต์ call rates สูงถึง 99% ในราคาประหยัด
เครื่อง MassARRAY® System สามารถรองรับงานในกลุ่ม Agrigenomics ได้ดังนี้