MassARRAY® System
MassARRAY® System ผลิตภัณฑ์ของบริษัท Agena Bioscience ประเทศสหรัฐอเมริกา เป็นชุดเครื่องมือตรวจวิเคราะห์ DNA และ RNA ที่สามารถตรวจวิเคราะห์ได้ทั้งในเชิงปริมาณ และเชิงคุณภาพ โดยไม่ได้อาศัยหลักการติดฉลากสารเรืองแสง (non-fluorescent detection) เหมือนเทคนิคอื่นๆ ทั่วไป
จุดเด่นที่เป็นเอกลักษณ์เฉพาะ (unique technique) คืออาศัยหลักการ primer extension ร่วมกับเครื่อง MassARRAY ซึ่งเป็นเครื่องมือวิเคราะห์น้ำหนักโมเลกุลของ DNA ที่มีความละเอียดสูงชนิด MALDI-TOF MS เพื่อวิเคราะห์ความแตกต่างและความจำเพาะของน้ำหนักโมเลกุล (mass) ของเบสบนสายนิวคลีโอไทด์ (nucleotide) ร่วมกับการประมวลผลโดยโปรแกรมที่ออกแบบมาเฉพาะกับงานด้านจีโนมิกส์ ให้ข้อมูลที่เข้าใจง่าย สะดวกต่อการใช้งาน
MassARRAY® เป็น open platform ที่ผสานเทคนิค mass spectrometry เข้ากับ end-point PCR ทำให้เกิดปฏิกิริยา multiplex ได้ภายใต้สภาวะ cycling เดียวกันทุกชุดน้ำยา มีให้เลือกทั้งรูปแบบเพลต 96 หลุม และ 384 หลุม เหมาะกับห้องปฏิบัติการที่ต้องการโฟกัสบริเวณยีนที่มีความสัมพันธ์กับโรคหรือลักษณะทางพันธุกรรมที่ทราบแล้ว โดยตรวจ genotyping, somatic mutation และการวิเคราะห์เชิงปริมาณได้บนแพลตฟอร์มเดียว
สามารถตรวจวิเคราะห์สารพันธุกรรมได้คราวละหลายตำแหน่งเป็น multiplexed assays ใช้ระยะเวลารวดเร็ว รายงานผลได้ภายใน 8 ชั่วโมง และมีราคาประหยัดเมื่อเทียบกับเทคนิคอื่น ปัจจุบันเทคนิค MassARRAY เป็นที่ยอมรับ และมีการตีพิมพ์ในวารสารงานวิจัยมากกว่า 3,000 ฉบับ
📌 ประยุกต์ใช้ได้หลากหลาย Application ได้แก่
Agena Bioscience มีรุ่น MassARRAY® Dx และ CE-IVD สำหรับห้องปฏิบัติการที่ต้องการระบบพร้อมใช้งานด้าน IVD หรือพัฒนาการทดสอบ IVD/CE-IVD ส่วนผลิตภัณฑ์อื่นทั้งหมดเป็น Research Use Only
⚙️ System Workflow
หลังสกัดกรดนิวคลีอิกแล้ว ใช้ตัวอย่างประมาณ 10–40 ng เข้าสู่ขั้นตอนง่ายๆ เพียง 3 ขั้นตอน โดยการตรวจวัดใช้ปฏิกิริยา multiplex end-point PCR ตามด้วย single base extension ภายใต้สภาวะ universal cycling
PCR / SAP / Extension
Multiplex end-point PCR ตามด้วยปฏิกิริยา single base extension
Target Sequence Detection
ถ่ายโอนสารตัวอย่างและเก็บข้อมูลโดยอัตโนมัติด้วย MALDI-TOF Mass Spectrometry
Data Analysis
แสดงผลข้อมูลและสร้างรายงานด้วยซอฟต์แวร์ Typer
| รูปแบบเพลต | 1. PCR / SAP / Extension | 2. Target Sequence Detection | 3. Data Analysis |
|---|---|---|---|
| 96 หลุม | Run time 5.5 ชม. Hands-on 23 นาที | Run time 100 นาที Hands-on 5 นาที | Hands-on 5–10 นาที |
| 384 หลุม | Run time 5.75 ชม. Hands-on 45 นาที | Run time 150 นาที Hands-on 5 นาที | Hands-on 5–10 นาที |
* เวลาของ workflow อาจแตกต่างกันตามชุดน้ำยาและการตั้งค่าการเก็บข้อมูล (ข้อมูลจาก Agena Bioscience)
ซอฟต์แวร์ใช้งานง่าย : Typer Software ใช้งานง่าย แปลผลง่ายในรูปแบบ Detected / Not Detected
MALDI-TOF Mass Spectrometry : ให้ผลทางพันธุกรรมที่ไวและแม่นยำ
Continuous Access : เติมตัวอย่างและน้ำยาได้ต่อเนื่อง ไม่มีเวลาว่างระหว่างแต่ละ batch เพื่อให้ได้ throughput สูงสุด
🧭 Available Applications
1Genotyping และ mutation detection
ชุด MassARRAY® System ร่วมกับชุดน้ำยา iPLEX® chemistry สามารถใช้ศึกษาในงานทางด้าน genotyping อันได้แก่ single nucleotide variations/polymorphisms (SNPs), insertions and deletions (indels) และ copy number variation (CNV) ซึ่งในปัจจุบันมีชุดตรวจวิเคราะห์สำเร็จรูปที่ถูกพัฒนาและสามารถใช้ได้ในกลุ่มงานทางด้านต่างๆ ดังนี้
Cancer Panels
Pharmacogenetic Panels
Blood Typing Panels
Sample Identification and Quantitation panels
2Ultra Sensitive Detection
ปัจจุบันทาง Agena Bioscience ได้พัฒนาชุดน้ำยา UltraSEEK™ ขึ้น เพื่อตอบสนองในกลุ่มงานวิจัยที่มี low abundance somatic mutations สามารถตรวจวัดโดยให้ sensitivity ต่ำสุดที่ 0.1% ด้วยชุดน้ำยานี้สามารถใช้วิเคราะห์กับตัวอย่างในกลุ่ม degraded sample ได้ เช่น liquid biopsy, needle aspirates และ formalin-fixed paraffin-embedded tissue (FFPE) เป็นต้น
📄 Download Brochure
3Methylation analysis
การศึกษา epigenetics ที่ปัจจุบันมีการศึกษากันอย่างกว้างขวางคือ DNA methylation ทางบริษัท Agena Bioscience ได้จัดทำ application รองรับงานทางด้าน DNA methylation โดยมีการออกแบบชุดซอฟต์แวร์ EpiTYPER สามารถดูตำแหน่ง methylation ได้หลายตำแหน่งพร้อมๆ กัน และสามารถตรวจเปอร์เซ็นต์ methylation ต่ำสุดได้ถึง 5% โดยชุดน้ำยาถูกออกแบบให้สามารถทำการตรวจได้อย่างรวดเร็ว ตั้งแต่ได้ตัวอย่าง bisulfite-treated DNA จนรายงานผลใช้เวลาไม่เกิน 8 ชั่วโมง
📄 Download Brochure
4Agricultural Genomics
ปัจจุบันความรู้ในระดับโมเลกุลทั้งในพืช และสัตว์ มีความก้าวหน้าและเป็นที่รู้จักกันอย่างแพร่หลาย การพัฒนาองค์ความรู้เหล่านั้นเพื่อให้เกิดประโยชน์สูงสุดเป็นสิ่งสำคัญ อาทิเช่น การเพิ่มผลผลิต และการพัฒนาสายพันธุ์ เป็นต้น
เครื่อง MassARRAY® นับเป็นเทคโนโลยีหนึ่งที่สามารถเข้ามามีบทบาทในงานทางด้าน Agricultural Genomics เนื่องจากสามารถศึกษา SNP หลายๆ ตำแหน่งพร้อมกัน (60 SNPs in a single multiplex assay) รองรับตัวอย่างได้เป็นจำนวนมาก (hundreds to thousands of specimens per day) มีเปอร์เซ็นต์ call rates สูงถึง 99% ในราคาประหยัด
🌱 เครื่อง MassARRAY® System สามารถรองรับงานในกลุ่ม Agrigenomics ได้ดังนี้
- การตรวจสอบการเป็นพ่อแม่พันธุ์ปศุสัตว์
- การตรวจสอบความถูกต้องของสายพันธุ์พืชและการคัดเลือกสายพันธุ์
- การประเมินเครื่องหมายพันธุกรรม (Marker) ในตัวอย่าง
- การตรวจลักษณะถ่ายทอดเชิงปริมาณ (trait locus)
- การศึกษาแหล่งกำเนิดของการผสมพันธุ์สัตว์
- การเลือกฟีโนไทป์
💬 สนใจ MassARRAY® System?
ทีมงาน Lifomics พร้อมให้คำปรึกษาด้านผลิตภัณฑ์และการประยุกต์ใช้งาน
📄 Download Brochure Contact US