การศึกษาและรักษามะเร็ง (Oncology) ในปัจจุบันเน้นการใช้ยารักษาแบบมุ่งเป้า (Targeted Drug Therapy) ตลอดจนการติดตามผลการรักษา (Follow up / Monitoring) ในผู้ป่วย โดยการตรวจสอบสารพันธุกรรมทำให้แพทย์ได้ทราบถึงการกลายพันธุ์ของยีนมะเร็ง เพื่อติดตามและประเมินผลการรักษา
ตัวอย่างที่ส่งตรวจส่วนใหญ่เป็นชิ้นเนื้อในรูปแบบพาราฟินบล็อค (Formalin-Fixed Paraffin-Embedded, FFPE) แต่ด้วยปริมาณชิ้นเนื้อที่จำกัด ทำให้ไม่สามารถตัดชิ้นเนื้อเพื่อตรวจวิเคราะห์เพิ่มได้อีก จึงต้องเฟ้นหาทางเลือกใหม่ที่ตรวจวิเคราะห์สารพันธุกรรมได้ในปริมาณน้อยมาก อีกทั้งตัวอย่างบางชนิดมีปริมาณเซลล์มะเร็งต่ำหรือคุณภาพ DNA ไม่ดี ซึ่งอาจทำให้เทคโนโลยีบางประเภทไม่สามารถรายงานผลได้
MassARRAY® จึงเป็นเทคโนโลยีที่ตอบโจทย์ด้วยคุณสมบัติ ความไวสูง (High Sensitivity) และ ความถูกต้องแม่นยำสูง (High Accuracy) โดยชุดตรวจใช้ปฏิกิริยา multiplex ทำให้ได้ข้อมูลของหลายตำแหน่งการกลายพันธุ์พร้อมกัน ภายใน workflow ที่จบได้ในหนึ่งวัน และมีต้นทุนต่ำ สามารถประยุกต์ใช้วิธีการตรวจที่สะดวกกว่า คือ “Liquid Biopsy” ซึ่งเป็นการตรวจหายีนมะเร็งจากกระแสเลือด (circulating DNA) ได้อีกด้วย
📌 ชุดตรวจครอบคลุมยีนหลักและมะเร็งหลายชนิด ได้แก่
Single-day workflow : ได้ข้อมูลของหลายตำแหน่งการกลายพันธุ์อย่างรวดเร็วในวันเดียว และมีต้นทุนต่ำ
Multiplexed chemistry : ตรวจ SNPs, insertions, deletions, translocations และ methylation ได้ด้วยชุดตรวจสำเร็จรูป หรือออกแบบ panel เอง
รองรับตัวอย่างปริมาณน้อย : iPLEX® HS และ UltraSEEK® chemistry ตรวจหา variants สำคัญได้จาก DNA ในปริมาณต่ำ
| หัวข้อ | UltraSEEK® Panels | iPLEX® HS Panels |
|---|---|---|
| ตัวอย่างที่ตรวจ | Liquid Biopsy (cfDNA / ctDNA จากพลาสมา, circulating tumor cells) | Heterogeneous Solid Tumor (fresh, frozen, FFPE tissue, fine needle aspirates, cytology blocks) |
| Sensitivity ต่ำสุด | 0.1% allele frequency | 1% allele frequency |
| DNA input ต่อปฏิกิริยา | ≥ 10 ng หรือ ≥ 3,300 copies | ≥ 10 ng หรือ ≥ 3,300 copies |
| Panels | Lung, Colon, Melanoma, EGFR | Lung, Colon, Melanoma, PIK3CA Breast |
| การใช้งานหลัก | Disease monitoring และตรวจ low abundance mutations / resistance markers | Mutation profiling ของ solid tumor ที่ปริมาณหรือคุณภาพตัวอย่างจำกัด |
* ข้อมูลจาก Agena Bioscience ชุดตรวจทั้งหมดเป็น Research Use Only
Liquid Biopsy เป็นการตรวจหายีนมะเร็งจากกระแสเลือด (circulating DNA) ซึ่งเข้าถึงตัวอย่างได้ง่าย แต่มี ctDNA เพียงไม่กี่ copies ต่อ mL ของพลาสมา จึงต้องอาศัยความไวสูงและการตรวจหลายตำแหน่งพร้อมกัน ชุดน้ำยา UltraSEEK® ตรวจ mutations ต่ำสุดที่ 0.1% allele frequency และด้วยความสามารถ multiplex ทำให้ตรวจได้มากกว่า 100 variants รวมถึง insertions และ deletions จาก cfDNA ในการเจาะเลือดเพียงครั้งเดียว เหมาะสำหรับการติดตามโรค (disease monitoring) และตรวจ resistance markers ที่เกิดขึ้นใหม่
ชุดน้ำยาสามารถตรวจวิเคราะห์ mutations ต่ำสุดที่ 0.1% allele frequency ในกลุ่มยีน KRAS, NRAS, EGFR และ PIK3CA สำหรับมะเร็งลำไส้ใหญ่และไส้ตรงจาก cfDNA
ชุดน้ำยาสามารถตรวจวิเคราะห์ mutations ต่ำสุดที่ 0.1% allele frequency ในกลุ่มยีน BRAF, EGFR, ERBB2, KRAS และ PIK3CA สำหรับมะเร็งปอดชนิด non-small cell (NSCLC) จาก cfDNA
ชุดตรวจสำหรับ Liquid Biopsy เพื่อตรวจหา EGFR resistance markers จาก cfDNA
ชุดตรวจสำหรับ Liquid Biopsy เพื่อตรวจหา variants ที่เกี่ยวข้องกับมะเร็งผิวหนังชนิด melanoma จาก cfDNA
งานวิจัยด้าน precision oncology ต้องการการตรวจ somatic variants ที่รวดเร็วและต้นทุนต่ำ แต่ตัวอย่างมักมีปริมาณและคุณภาพจำกัด เทคโนโลยีบางประเภทต้องการตัวอย่างที่มีสัดส่วนเซลล์มะเร็งสูง และอาจต้องตัดตัวอย่างที่มี tumor fraction หรือ DNA yield ต่ำออกไป ชุดน้ำยา iPLEX® HS ตรวจ mutations ต่ำสุดที่ 1% allele frequency จาก DNA ปริมาณน้อย ใช้ได้กับตัวอย่าง fresh, frozen และ FFPE tissue, fine needle aspirates และ cytology blocks
ชุดน้ำยาสามารถตรวจวิเคราะห์ mutations ต่ำสุดที่ 1% allele frequency ในกลุ่มยีน KRAS, NRAS, EGFR และ PIK3CA สำหรับมะเร็งลำไส้ใหญ่และไส้ตรง
ชุดน้ำยาสามารถตรวจวิเคราะห์ mutations ต่ำสุดที่ 1% allele frequency ในกลุ่มยีน BRAF, EGFR, ERBB2, KRAS และ PIK3CA สำหรับมะเร็งปอดชนิด non-small cell (NSCLC)
ชุดตรวจ mutation profiling สำหรับมะเร็งผิวหนังชนิด melanoma
ชุดตรวจ PIK3CA variants สำหรับงานวิจัยมะเร็งเต้านม
นอกจากชุดตรวจสำหรับ Liquid Biopsy และ Solid Tumor แล้ว ยังมี panel ที่ครอบคลุมตำแหน่งการกลายพันธุ์จำนวนมากสำหรับงานวิจัยเชิงลึก
ครอบคลุมมากกว่า 300 somatic mutations ใน 4 oncogenes (EGFR, KRAS, NRAS และ BRAF) ที่เกี่ยวข้องกับ lung, colorectal และ metastatic tumors
ครอบคลุมมากกว่า 250 somatic mutations ใน 26 ยีน ที่เกี่ยวข้องกับ non-small cell lung cancer (NSCLC)
ชุดตรวจวิเคราะห์ oncogenic fusion ของยีน ALK, RET หรือ ROS1
Sample Requirements
• Liquid Biopsy : DNA จากพลาสมา, circulating cell-free DNA และ circulating tumor cells
• Solid Tumor : DNA จากเนื้อเยื่อสด, แช่แข็ง หรือพาราฟินบล็อค (FFPE), fine needle aspirates และ cytology blocks
• DNA input ต่อปฏิกิริยา : ≥ 10 ng หรือ ≥ 3,300 copies ของ amplifiable template
Custom Assay Design
นักวิทยาศาสตร์ของ Assays by Agena ออกแบบและพัฒนา custom assay (Research Use) ได้ทั้ง germline หรือ somatic genotyping, translocations, copy number variants และ methylation profiling จึงสามารถออกแบบตำแหน่งยีนที่เกิดการกลายพันธุ์ได้เอง
ทีมงาน Lifomics พร้อมให้คำปรึกษาด้านผลิตภัณฑ์และการประยุกต์ใช้งาน
📄 Oncology Overview Brochure Contact US